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蘇曉泉教授團隊在微生物組機器學習領域發表綜述論文

日期:2021-05-10      來源:計算機科學技術學院      作者:     編輯:郭書君       閲讀:1

新聞網訊 近日,計算機科學技術學院蘇曉泉教授團隊在Computational and Structural Biotechnology Journal(SCI IF=6.018)期刊發表綜述論文。該項工作通過近15,000例菌羣樣本的分析建模,證實了共存病和併發症對微生物組數據模型的顯著影響和干擾,反映出常規機器學習方法魯棒性低、漏檢率高等缺陷和不足。論文同時指出,多標籤分類(multi-label classification)技術有望成為微生物組疾病檢測的新方案,並總結了微生物組多標籤分類中值得關注的要點和難點問題,從而激發微生物組進一步研究和實際臨牀應用的新方向和新思路。

計算機科學技術學院青年教師吳舜堯博士和碩士研究生陳俞竹為該論文的共同第一作者,蘇曉泉教授為該論文的通訊作者。該項研究得到了國家自然科學基金和山東省自然科學基金的支持。

據瞭解,人體微生物組(菌羣)被稱為人的“第二基因組”,已被證實與人的健康狀態和疾病的發生發展有着密切的關聯,在疾病預測與診治等方面有着巨大潛力。長久以來,機器學習被廣泛地應用於微生物組研究中,通過對不同狀態的微生物組樣本進行訓練並構建預測模型,對待檢測樣本的狀態進行識別。